国内用語コードに対する、当面のOMOP concept IDの割り当て方

日本の用語コードに対するODHSIボキャブラリの正式な割当ができるまでの仮の方法として
下記のようにすることを提案する。

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『傷病、医薬品、特定機材、医科診療行為のレセ電コードを、一定の規則で
　20億番～21億番未満の番号に変換し、それをconcept IDとする。』

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• マッピング表を利用するのではなく、規則（ルール）により変換する。ETLプログラムに実装できる。

• OMOP concept IDでは、20億番以上はローカル用途に使う領域になっている。

• その領域のうち、20億番～21億番未満の番号を使用する。21億番以上(～2,147,483,647)は使用しないので、本当にローカルな用途に4000万個以上の領域を引き続き使用できる。

• 本規則により割り当てられた20億番以上の番号を、2B-J IDと呼称する。

• 2B-J IDは日本ローカルな、しかし日本共通のOMOP concept IDである。

• 2B-J IDからOMOP 標準のconcept IDへのマッピングを別途整備する。これにより日本の用語コードをOMOP標準concept IDへ変換できるようになる。

• CDM各テーブルへの格納はこのようになる。

　*_concept_id : OMOP標準conceptのIDを入れるもので、日本のコード/用語は入らない。

　*_source_concept_id: 本規則で導出された番号(2B-J ID)を格納する。

　*_source_value: 元データのコードを入れる。コード体系はレセ電とは限らない。

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• 元データの用語コード体系がレセ電コードではない場合、一旦レセ電コードに変換した後、本規則によるconcept IDを導出する。

• ICD10についてはAthenaにマッピング表があるため本規則は必要ない。

• 検体検査はレセ電では一部粒度が不足するため、元データがレセ電でない場合の別途対応を加える予定。

• ATLAS等で使うためには、Custom Vocablary が必要で、これも別途整備する予定。

(Athenaから取得したvacablaryと同様に、CDMのvacablaryとして取り込めるようにする。)

• 将来Athenaに収録されたときには、concept IDが変わることになるが、*_source_valueに元コードがあるので、その情報をもとにAthenaを引けばよい。

• レセ電コードの範囲変更等により、本規則を随時変更することがある。2B-J IDに限らずボキャブラリが更新されたときには、再マッピングを必要にあわせ実施しなくてはならない。

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《変換規則》ver.202205
　※見やすくするためにコード・ID番号中に空白を挟んでいるが、除去して使用する。